Gennem forskning og risikovurdering skaber afdelingen et sikkert videnskabeligt grundlag for rådgivning til Fødevarestyrelsen, Miljøstyrelsen og Skov- og Naturstyrelsen. Aktiviteterne omfatter fødevaresikkerhed og sundhedsfremme samt menneskers sundhedsrisiko ved udsættelse for kemiske stoffer og genteknologisk modificerede organismer.
Forskning og rådgivning dækker såvel toksikologiske og kemiske som genteknologiske områder: Kostens basale komponenter, tilsætningsstoffer, fødevareteknologi, kemiske forureninger i fødevarer, kemiske stoffer og produkter samt genteknologiske organismer og produkter.
Afdelingen leverer data om GMO-konstruktioner i produkter fra transgene planter til EU´s referencelaboratorium til brug for validering af kontrolmetoder. Dernæst er afdelingen DANAK-akkrediteret til kvantitativ bestemmelse af Bt 11 i majs.